Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL33A6NCF5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms