Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPQQ9Y646 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPQQ9Y646 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPQQ9Y646 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPQQ9Y646 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms