Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
WASHC2CQ9Y4E1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
WASHC2CQ9Y4E1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
WASHC2CQ9Y4E1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
WASHC2CQ9Y4E1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
WASHC2CQ9Y4E1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms