Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPS1Q9UHF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPS1Q9UHF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPS1Q9UHF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPS1Q9UHF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPS1Q9UHF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms