Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
IFT172Q9UG01 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT172Q9UG01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT172Q9UG01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT172Q9UG01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IFT172Q9UG01 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT172Q9UG01 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms