Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CLIP2Q9UDT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP2Q9UDT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP2Q9UDT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms