Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG4Q9UBN1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG4Q9UBN1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG4Q9UBN1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms