Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A9Q9NUM3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC39A9Q9NUM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC39A9Q9NUM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A9Q9NUM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms