Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SALL1Q9NSC2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL1Q9NSC2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL1Q9NSC2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SALL1Q9NSC2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SALL1Q9NSC2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms