Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A11Q9NSA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A11Q9NSA0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A11Q9NSA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms