Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TULP4Q9NRJ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TULP4Q9NRJ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TULP4Q9NRJ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms