Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCXQ9H320 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCXQ9H320 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms