Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIPCQ9C0C6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIPCQ9C0C6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219 ms