Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms