Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSM14BQ9BX40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSM14BQ9BX40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LSM14BQ9BX40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LSM14BQ9BX40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms