Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX1Q96RV3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX1Q96RV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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