Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GSDMAQ96QA5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GSDMAQ96QA5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSDMAQ96QA5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSDMAQ96QA5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMAQ96QA5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms