Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms