Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ROBO3Q96MS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ROBO3Q96MS0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ROBO3Q96MS0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms