Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PRAC1Q96KF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PRAC1Q96KF2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms