Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRELD1Q96HD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRELD1Q96HD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRELD1Q96HD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRELD1Q96HD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRELD1Q96HD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRELD1Q96HD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRELD1Q96HD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms