Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG4CQ96DT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG4CQ96DT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG4CQ96DT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG4CQ96DT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms