Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB22

SPATA20, Spermatogenesis-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20Q8TB22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA20Q8TB22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA20Q8TB22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA20Q8TB22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA20Q8TB22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA20Q8TB22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA20Q8TB22 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA20Q8TB22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPATA20Q8TB22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA20Q8TB22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA20Q8TB22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms