Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC44A5Q8NCS7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC44A5Q8NCS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC44A5Q8NCS7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC44A5Q8NCS7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC44A5Q8NCS7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms