Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5AQ8N6Q1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO5AQ8N6Q1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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