Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
VPS8Q8N3P4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
VPS8Q8N3P4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
VPS8Q8N3P4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
VPS8Q8N3P4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
VPS8Q8N3P4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
VPS8Q8N3P4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
VPS8Q8N3P4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
VPS8Q8N3P4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms