Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00528Q8N1L1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00528Q8N1L1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms