Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALYREFQ86V81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALYREFQ86V81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALYREFQ86V81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms