Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX8Q7RTT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX8Q7RTT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSX8Q7RTT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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