Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIGD1Q6UXZ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIGD1Q6UXZ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIGD1Q6UXZ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMIGD1Q6UXZ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMIGD1Q6UXZ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD1Q6UXZ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD1Q6UXZ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms