Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNCKQ6P2M8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNCKQ6P2M8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNCKQ6P2M8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms