Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2CQ496J9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SV2CQ496J9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SV2CQ496J9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2CQ496J9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms