Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM187BQ17R55 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM187BQ17R55 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM187BQ17R55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM187BQ17R55 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM187BQ17R55 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM187BQ17R55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM187BQ17R55 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM187BQ17R55 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM187BQ17R55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM187BQ17R55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms