Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2ACQ16777 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ACQ16777 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2ACQ16777 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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