Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDK4Q16654 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK4Q16654 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK4Q16654 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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