Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPE65Q16518 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPE65Q16518 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPE65Q16518 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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