Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA6Q16445 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABRA6Q16445 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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