Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHRNA2Q15822 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHRNA2Q15822 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHRNA2Q15822 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHRNA2Q15822 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CHRNA2Q15822 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms