Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB3Q13751 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB3Q13751 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms