Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLFQ13129 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLFQ13129 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLFQ13129 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLFQ13129 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLFQ13129 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLFQ13129 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLFQ13129 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RLFQ13129 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RLFQ13129 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLFQ13129 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLFQ13129 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLFQ13129 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLFQ13129 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLFQ13129 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLFQ13129 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLFQ13129 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLFQ13129 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLFQ13129 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLFQ13129 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RLFQ13129 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RLFQ13129 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLFQ13129 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLFQ13129 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLFQ13129 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLFQ13129 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLFQ13129 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RLFQ13129 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RLFQ13129 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLFQ13129 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RLFQ13129 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RLFQ13129 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RLFQ13129 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RLFQ13129 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLFQ13129 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLFQ13129 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLFQ13129 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLFQ13129 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLFQ13129 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RLFQ13129 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RLFQ13129 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RLFQ13129 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RLFQ13129 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLFQ13129 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLFQ13129 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLFQ13129 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLFQ13129 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLFQ13129 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RLFQ13129 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RLFQ13129 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLFQ13129 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLFQ13129 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RLFQ13129 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLFQ13129 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLFQ13129 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RLFQ13129 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLFQ13129 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLFQ13129 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLFQ13129 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLFQ13129 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLFQ13129 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLFQ13129 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLFQ13129 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RLFQ13129 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLFQ13129 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLFQ13129 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLFQ13129 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLFQ13129 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RLFQ13129 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RLFQ13129 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLFQ13129 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLFQ13129 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLFQ13129 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLFQ13129 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLFQ13129 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLFQ13129 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLFQ13129 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLFQ13129 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLFQ13129 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLFQ13129 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLFQ13129 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLFQ13129 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLFQ13129 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLFQ13129 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RLFQ13129 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RLFQ13129 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLFQ13129 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLFQ13129 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RLFQ13129 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLFQ13129 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RLFQ13129 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RLFQ13129 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLFQ13129 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLFQ13129 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
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