Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRDM2Q13029 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRDM2Q13029 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
PRDM2Q13029 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
PRDM2Q13029 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PRDM2Q13029 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC43.7■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
PRDM2Q13029 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
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