Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 PRY2YKR013W 990 nt7.22□□□□□ -1.25
VIK1Q12045 RRN10YBL025W 438 nt7.22□□□□□ -1.25
VIK1Q12045 HTS1YPR033C 1641 nt7.22□□□□□ -1.25
VIK1Q12045 YCR061WYCR061W 1896 nt7.21□□□□□ -1.25
VIK1Q12045 FCY2YER056C 1602 nt7.21□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 DST1YGL043W 930 nt7.21□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.21□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 NAP1YKR048C 1254 nt7.21□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 EFM1YHL039W 1758 nt7.2□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 JHD1YER051W 1479 nt7.2□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 YLR112WYLR112W 420 nt7.2□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 VPS65YLR322W 315 nt7.2□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 YPL108WYPL108W 507 nt7.2□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 ACO1YLR304C 2337 nt7.19□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 ERG12YMR208W 1332 nt7.18□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 DAL7YIR031C 1665 nt7.17□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 RAD51YER095W 1203 nt7.17□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 CAR2YLR438W 1275 nt7.17□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 YDR327WYDR327W 327 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 CPR2YHR057C 618 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 CDC3YLR314C 1563 nt7.16□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 YMR206WYMR206W 942 nt7.15□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 BXI1YNL305C 894 nt7.15□□□□□ -1.26
VIK1Q12045 NUP57YGR119C 1626 nt7.15□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YDR215CYDR215C 414 nt7.14□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 EMP65YER140W 1671 nt7.14□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 SMK1YPR054W 1167 nt7.14□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YPR084WYPR084W 1371 nt7.13□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 ERV25YML012W 636 nt7.13□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 RPS6AYPL090C 711 nt7.12□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 RPS6BYBR181C 711 nt7.12□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YPC1YBR183W 951 nt7.12□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 LIP5YOR196C 1245 nt7.11□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YAH1YPL252C 519 nt7.11□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 CLN1YMR199W 1641 nt7.11□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 CYB2YML054C 1776 nt7.1□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YGL260WYGL260W 231 nt7.1□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YKL147CYKL147C 618 nt7.1□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 FCY1YPR062W 477 nt7.1□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 YER156CYER156C 1017 nt7.09□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 SKY1YMR216C 2229 nt7.09□□□□□ -1.27
VIK1Q12045 ASN2YGR124W 1719 nt7.08□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 DAL80YKR034W 810 nt7.08□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 ECM30YLR436C 3825 nt7.08□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 CIR2YOR356W 1896 nt7.08□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 PET18YCR020C 648 nt7.07□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 NTG1YAL015C 1200 nt7.07□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 RSP5YER125W 2430 nt7.07□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 ATP2YJR121W 1536 nt7.06□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 EXG2YDR261C 1689 nt7.06□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 ARC35YNR035C 1029 nt7.06□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 MCH2YKL221W 1422 nt7.06□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 PRP2YNR011C 2631 nt7.05□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 ADE17YMR120C 1779 nt7.05□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 NMD5YJR132W 3147 nt7.05□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 YOS9YDR057W 1629 nt7.05□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 ERG24YNL280C 1317 nt7.04□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 STE3YKL178C 1413 nt7.04□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 GRH1YDR517W 1119 nt7.04□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 MTR3YGR158C 753 nt7.04□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 YEN1YER041W 2280 nt7.04□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 NUP84YDL116W 2181 nt7.03□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 TOS2YGR221C 1869 nt7.03□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 YHR131CYHR131C 2553 nt7.03□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 RPL2BYIL018W 765 nt7.03□□□□□ -1.28
VIK1Q12045 BIM1YER016W 1035 nt7.02□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YIP4YGL198W 708 nt7.02□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 OPI1YHL020C 1215 nt7.02□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.02□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 HSM3YBR272C 1443 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YNL295WYNL295W 1575 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 FPR2YDR519W 408 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 CTF8YHR191C 402 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YJL064WYJL064W 396 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YJL160CYJL160C 864 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 INP54YOL065C 1155 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 AFG3YER017C 2286 nt7.01□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 GTT3YEL017W 1014 nt7□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 GET2YER083C 858 nt7□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 HMS2YJR147W 1077 nt7□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 OPI11YPR044C 354 nt7□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 SNT309YPR101W 528 nt7□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 SEN2YLR105C 1134 nt6.99□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 MFT1YML062C 1179 nt6.99□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 PAU19YMR325W 375 nt6.99□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 TAH11YJR046W 1815 nt6.97□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 RRP43YCR035C 1185 nt6.97□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 TPK1YJL164C 1194 nt6.97□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YAL045CYAL045C 309 nt6.97□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 DPH5YLR172C 903 nt6.97□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 YLL066CYLL066C 3618 nt6.96□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 GSH1YJL101C 2037 nt6.96□□□□□ -1.29
VIK1Q12045 BDS1YOL164W 1941 nt6.96□□□□□ -1.3
VIK1Q12045 ERS1YCR075C 783 nt6.96□□□□□ -1.3
VIK1Q12045 SWM1YDR260C 513 nt6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms