Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CPSF1Q10570 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CPSF1Q10570 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPSF1Q10570 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CPSF1Q10570 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPSF1Q10570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
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