Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP6Q0PNE2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELP6Q0PNE2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELP6Q0PNE2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP6Q0PNE2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms