Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX9Q08211 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX9Q08211 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DHX9Q08211 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms