Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAX8Q06710 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX8Q06710 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX8Q06710 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX8Q06710 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms