Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTN2Q02246 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTN2Q02246 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTN2Q02246 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms