Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCEQ02156 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCEQ02156 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRKCEQ02156 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms