Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTENP60484 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTENP60484 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTENP60484 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTENP60484 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTENP60484 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTENP60484 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTENP60484 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTENP60484 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTENP60484 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTENP60484 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTENP60484 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTENP60484 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTENP60484 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTENP60484 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTENP60484 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTENP60484 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTENP60484 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTENP60484 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTENP60484 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTENP60484 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTENP60484 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTENP60484 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTENP60484 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTENP60484 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTENP60484 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTENP60484 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTENP60484 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTENP60484 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTENP60484 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTENP60484 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTENP60484 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTENP60484 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTENP60484 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTENP60484 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTENP60484 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTENP60484 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTENP60484 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTENP60484 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTENP60484 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTENP60484 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTENP60484 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTENP60484 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTENP60484 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTENP60484 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTENP60484 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTENP60484 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTENP60484 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTENP60484 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTENP60484 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTENP60484 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTENP60484 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTENP60484 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTENP60484 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTENP60484 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTENP60484 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTENP60484 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTENP60484 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTENP60484 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTENP60484 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTENP60484 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTENP60484 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTENP60484 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTENP60484 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTENP60484 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTENP60484 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTENP60484 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTENP60484 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTENP60484 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTENP60484 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTENP60484 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTENP60484 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTENP60484 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTENP60484 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTENP60484 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTENP60484 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTENP60484 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTENP60484 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTENP60484 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTENP60484 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTENP60484 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTENP60484 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTENP60484 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTENP60484 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTENP60484 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTENP60484 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTENP60484 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTENP60484 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTENP60484 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTENP60484 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTENP60484 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTENP60484 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms