Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP12AP54707 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP12AP54707 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms